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- 水稻优质多抗重要基因挖掘与种质创新,江苏省种业振兴“揭榜挂帅”项目,
- 主粮作物优质重要基因挖掘和种质创新,海南省崖州湾种子实验室2021年揭榜挂帅项目,
- 稻米消化特性的遗传解析及其育种利用,国家自然科学基金项目-国际(地区)合作与交流项目,
- 中国-马来西亚高产优质水稻种质创新与育种技术的合作研发,江苏省政策引导类计划（国际科技合作/港澳台科技合作）,
- 水稻品质性状遗传与改良,国家杰出青年基金项目,
- 稻米淀粉品质改良优异种质资源挖掘及其遗传与结构基础研究,国家自然科学基金国际(地区)合作与交流项目,刘巧泉,
- 胚乳淀粉累积的分子调控机制,自然类国家级-国家重点技术研究发展计划（973项目）,刘巧泉,
- 优质食味/营养品质转基因水稻新品种培育,国家重大专项（转基因等）,刘巧泉,
- 高赖氨酸含量转基因水稻新品系的选育,刘巧泉,
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- 水稻籽粒赖氨酸累积的分子调控及其代谢关联研究,国家自然科学基金面上项目,刘巧泉,
- 水稻淀粉品质形成与调控重要基因的克隆与功能研究,国家转基因重大专项,刘巧泉,
- 基因表达调控技术研究,国家转基因重大专项,刘巧泉,
- 优质转基因水稻新品种培育,国家转基因重大专项,刘巧泉,
- 优质性状的分子机制与设计,973计划（参加）,刘巧泉,
